Возникновение старообрядческого церковного прихода в городе Ковне (ныне г.Каунас) относится к первой половине XIX века, когда по инициативе благочестивых старообрядцев было воздвигнуто небольшое здание – дом для молитвы, в котором началось совершение церковных богослужений.

В 1905 году с провозглашением закона о веротерпимости ковенским староверам удалось получить разрешение на постройку своего храма. Так как ковенцы еще не имели собственного прихода, и здания для храма и молитвы, прихожанка Е.Е.Прозорова предоставила часть своего дома для проведения богослужений. Пока строилось здание, молились в доме Прозоровой. Духовным наставником был избран А.М.Селюгин (умер в России во время войны 1914 года). Учителя церковного пения и головщика Ф.С.Павлова пригласили из Петербурга.

Ковенский храм был закончен в 1907 году, освящен во имя святителя Николы Чудотворца. Здание кирпичное, существует по сей день.

Во время немецкой оккупации 1914 г., храм был брошен без надзора бежавшими прихожанами. Колокола вывезли в Россию, было похищено большое паникадило.

После войны Ковенский храм отремонтировали, но колокола вернули только в 30-е годы. Установили и новое паникадило. Духовным наставником избрали Н.И.Козловского.

Стала работать церковная старообрядческая школа по солевому пению и были открыты 2-годичные курсы для лиц, желающих посвятить себя религиозному воспитанию старообрядческих детей. Возглавил эту работу И.А.Прозоров.

Ковенский храм построен из красного кирпича и существует до сегодняшнего дня. Много в нем служило известных духовных наставников, в т.ч. Никитин И.И. и Панцырев В.Д. – ныне почившие. В настоящее время духовным наставником храма избран Федоров Иоанн Харисанфович. Председателем Каунасской общины является Пономарев Федор Артемьевич.

Каунасская община активно участвует в жизни старообрядчества. Храм в хорошем состоянии, здание внутри содержится в порядке. Иконы в храме придают торжественность и величие. Служба в храме ведется на два клироса, пение слаженное, звучит красиво и радует душу прихожан.